An der KU sind zwei Fachhochschulfakultäten angesiedelt, deren englische Bezeichnung "University of Applied Sciences" sehr gut wiederspiegelt, wofür Fachhochschulen vor allem stehen: hoher Praxisbezug und starke Anbindung an die Arbeitswelt. Der starke Anwendungsbezug macht sich auch im Profil der Dozenten bemerkbar: Viele von ihnen bringen Berufserfahrungen mit, was sie befähigt, den Studierenden Einblicke in die Abläufe, Arbeitsweisen und Erwartungen kirchlicher und sozialer Einrichtungen zu vermitteln. Obligatorische Studienpraktika runden den Wissens- und Praxistransfer für die Studierenden ab.

An der KU werden folgende FH-Studiengänge angeboten:

• Bildung und Erziehung in Kindheit und Jugend
• Religionspädagogik und Kirchliche Bildungsarbeit
• Soziale Arbeit
• NEU ab WS 2012/2013: Bachelor-Studiengang Pflegewissenschaft

• Gestuftes Studienprogramm mit der Hochschule Ingolstadt:
  Ausbildung von Lehrkräften an beruflichen Schulen (Metalltechnik),
  mit zunächst Maschinenbau und berufliche Bildung