Mit Stiftungsurkunde vom 15. März 1987 hat der Erzbischof von München und Freising, Friedrich Kardinal Wetter, bei der Stiftung Katholische Universität Eichstätt eine unselbständige Zustiftung errichtet, "für den fortdauernden Zweck des Unterhalts einer Gastprofessur in der Geschichts- und Gesellschaftswissenschaftlichen Fakultät der Katholischen Universität Eichstätt". "Die Stiftung trägt den Namen „Otto von Freising – Gastprofessur“ Zustiftung der Erzdiözese München und Freising. Mit der Erinnerung an den Freisinger Bischof und Geschichtsschreiber (1138 - 1158) soll das Andenken an die große geschichtswissenschaftliche Tradition in Altbayern wachgehalten werden."
Der Fachbereichsrat der Geschichts- und Gesellschaftswissenschaftlichen Fakultät hat daraufhin beschlossen, die Mittel dieser Zustiftung im Semesterturnus den in der Fakultät vertretenen Fachdisziplinen zur jeweils fachbezogenen Besetzung der Gastprofessur zuzuteilen. Neben dem Veranstaltungsprogramm sollten die Inhaber der Gastprofessur einen öffentlichen Gastvortrag aus ihrem jeweiligen Forschungsprogramm halten.
Bislang waren folgende Wissenschaftler Inhaber der Otto von Freising-Gastprofessur:
2010 - heute
WiSe 2017/18 Theodore (Ted) R. Schatzki, Prof. Dr.
WiSe 2016/17 Gilles Reckinger, Prof. Dr.
SoSe 2016 Paul Kirchhof, Prof. Dr. Dres. h.c.
WiSe 2015/16 Winfried Nerdinger, Prof. Dr.
SoSe 2015 Andrea Maurer, Prof. Dr.
WiSe 2014/15 Norbert Fischer, Prof. Dr.
SoSe 2014 Heinrich Oberreuter, Prof. Dr. Dr. h.c.
WiSe 2012/13 Sabine Maasen, Prof. Dr.
SoSe 2012 Nikolaus Böttcher, PD Dr.
WiSe 2011/12 Ralf Alleweldt, PD Dr. jur.
SoSe 2011 Werner Eck, Prof. Dr. Dr. h.c.mult.
SoSe 2010 Josef Isensee, Prof. Dr. Dr. h.c.
SoSe 2010 Ronald Hitzler, Prof. Dr.
2000 - 2009
SS 2009 Kaspar Maase, Prof. Dr.
SS 2008 Jörn Rüsen, Prof. Dr.
WS 2007/08 Michaela Wittinger, PD Dr.
WS 2006/07 Willfried Spohn, PD Dr.
SS 2006 Rainer Tetzlaff, Prof. Dr.
WS 2005/06 Alois Schmid, Prof. Dr.
SS 2005 Jan Spurk, Prof. Dr.
WS 2004/05 Manfred Brocker, PD Dr. Dr.
SS 2004 Toni Pierenkemper, Prof. Dr.
WS 2003/04 Stefan Brüne, Prof. Dr.
WS 2002/03 Andreas Wirsching, Prof. Dr.
SS 2002 Alois Hahn, Prof. Dr.
WS 2001/02 Martin Sebaldt, PD Dr.
WS 2000/01 Walter Hartinger, Prof. Dr.
SS 2000 Antonio Scaglia, Prof. Dr.
1990 - 1999
SoSe 1999 Klaus Schreiner, Prof. Dr.
SoSe 1998 Uwe Backes, PD Dr.
WS 1997/98 Gerhard A. Ritter, Prof. Dr. Dr. h.c.
SS 1996 Horst Schüler-Springorum, Prof. Dr.
SS 1995 Wolfgang Brückner, Prof. Dr.
WS 1995/96 Manfred Hättich, Prof. Dr.
WS 1994/95 Thomas Wiedenmann, Prof. Dr.
SS 1994 Franz-Xaver Kaufmann, Prof. Dr.
WS 1993/94 Hans-Georg Wieck, Prof. Dr.
SS 1993 Frantisek Smahel, Prof. Dr.
WS 1992/93 Karl Martin Bolte, Prof. Dr. Dr. h.c.
WS 1991/92 Magnus Mörner, Prof. Dr.
SS 1991 Roland Girtler, Prof. Dr.
WS 1990/91 Hans Buchheim, Prof. Dr.
SS 1990 Dimitrij Zlepko, Prof. Dr.
1988/89
SS 1989 Odilo Engels, Prof. Dr.
WS 1988/89 Berndt von Staden, Prof. Dr.
WS 1988/89 Wilhelm G. Grewe, Prof. Dr.