Manfred Clauss’ Forschung verband Alte Geschichte, lateinische Epigraphik und Religionsgeschichte in besonderer Weise. Sein bedeutendstes wissenschaftliches Vermächtnis ist die Epigraphische Datenbank Clauss/Slaby, die lateinische Inschriften in großer Breite erschließt und bis heute ein zentrales Arbeitsinstrument der altertumswissenschaftlichen Forschung darstellt. Informationen zu seinen Forschungsschwerpunkten und Publikationen finden sich in der Bibliographie, in der ein ausführliches Schriftenverzeichnis hinterlegt ist.